El Laboratorio Mediambiental IQS fue creado en 1996 y está dedicado al análisis de contaminantes orgánicos persistentes, especialmente dioxinas, furanos y PCB. El laboratorio cuenta con los equipamientos necesarios para poder realizar dichos análisis, entre los que destacan los acoplamientos de cromatografía de gases a espectrometría de masas de alta resolución.

En 1999, fue el primer laboratorio español en obtener la acreditación para el análisis de dioxinas y furanos en emisiones atmosféricas. En 2004 fue de nuevo el primer laboratorio en ser acreditado por ENAC para el análisis de dioxinas y furanos en alimentos. Esas acreditaciones se han mantenido hasta la actualidad, y se han extendido a otros contaminantes en un amplio espectro de matrices.