Técnicas pioneras para la caracterización de oligonucleótidos

Los ácidos nucleicos y los oligonucleótidos son moléculas que tienen actualmente un papel muy importante en medicina, dado su papel como principios activos para desarrollar nuevas estrategias de medicina preventiva y terapias, que permitan, no sólo tratar enfermedades genéticas, sino también convertirse en inmunoterapias del cáncer, o en nuevas generaciones de vacunas profilácticas para enfermedades infecciosas. Por todo esto, en los últimos años ha aumentado el interés por el desarrollo de metodologías analíticas que permitan la identificación y la cuantificación de ácidos nucleicos y oligonucleótidos con suficiente sensibilidad, exactitud y precisión.  La espectrometría de masas acoplada a cromatografía líquida (LC-MS) es una de las técnicas analíticas que reúne los requisitos necesarios para llevar a cabo este tipo de análisis.

El laboratorio IQS-SCIEX Demo lab cuenta con la tecnología necesaria para realizar la determinación y caracterización de oligonucleótidos terapéuticos en diferentes puntos del proceso de desarrollo de la terapia. Por un lado, el instrumento X500B QTOF permite realizar un mapeado en diferentes muestras para identificar secuencias y modificaciones de oligonucleótidos, así como posibles impurezas. De este modo, es posible controlar que se está realizando la secuencia correcta de los oligonucleótidos durante el proceso de producción y caracterizar el producto final. Además, mediante la obtención de los espectros de MSMS, es posible identificar las diferentes modificaciones postranscripcionales, que son las que permiten modular la inmunogenicidad y la eficiencia del producto.

Por otro lado, el instrumento 7500QTrap permite cuantificar con elevada sensibilidad aquellas secuencias de mayor interés, pudiendo controlar así la pureza del producto obtenido.

Una línea de investigación pionera

Actualmente, en el IQS-SCIEX Demo lab se está llevando a cabo una línea de investigación dedicada a la caracterización de ácidos nucleicos terapéuticos, pionera en este campo. La investigación está codirigida por el Dr. Salvador Borrós, la Dra. Cristina Fornaguera y la Dra. Gemma Gotor, miembros del Grupo de Ingeniería de Materiales – GEMAT de IQS School of Engineering.

Dentro de esta línea de investigación, se ha puesto a punto una preparativa de muestra adecuada, que permita una correcta digestión enzimática de las cadenas de ARN y/o de ADN. Además, se ha desarrollado un método de cromatografía de líquidos que permite una separación óptima de los oligonucleótidos, así como diferentes métodos de espectrometría de masas para su identificación y cuantificación.

De este modo, se han podido identificar y optimizar diferentes flujos de trabajo que hacen posible la identificación y cuantificación de estos analitos con elevado interés terapéutico.

El próximo 29 de marzo, la Dra. Margalida Artigues, responsable del IQS-SCIEX Demo lab y miembro del Grupo de Electroquímica y Bioanálisis – EQBA de IQS, presentará los avances de esta investigación en un seminario organizado por SCIEX, que tendrá lugar en el Palau Robert de Barcelona, en el marco de la exposición CRIMS que se lleva a cabo en el mismo hasta el 10 de abril.